เมื่อสิบสองปีก่อน ปีศาจจิ้งจอกเก้าหาง ได้บุกเข้าโจมตีหมู่บ้าน โคโนฮะ ทำให้ (โฮคาเงะ รุ่นที่ 4) ซึ่งเป็นหัวหน้าหมู่บ้าน ต้องยอมพลีชีพเพื่อสะกดวิญญาณของปีศาจจิ้งจอกเก้าหาง ผนึกไว้ในร่างของทารกคนหนึ่ง นามว่า อุซึมากิ นารูโตะ
สิบสองปีถัดมา นารูโตะ ซึ่งเป็นกำพร้าและไม่มีพี่น้อง เติบโตขึ้นโดยไม่รู้ว่าตนเองมีจิ้งจอกเก้าหางอยู่ภายในร่างกาย หลังจากสำเร็จการศึกษาเป็นนินจาชั้น เกะนิน (นินจาระดับล่าง) และปฏิบัติหน้าที่ภายใต้การควบคุมของ ฮาตาเกะ คาคาชิ ซึ่งเป็น โจนิน (นินจาระดับสูง) ฉายา ก๊อบรักนะนินจา โดยมีสมาชิกร่วมทีมอีกสองคน คือ อุจิวะ ซาสึเกะ และ ฮารุโนะ ซากุระ
ทีมนินจาของคาคาชิได้รับภารกิจให้ความคุ้มครองทะสุนะ นักสร้างสะพานแห่งแคว้นนามิโนะคุนิจากซาบุซะจนสำเร็จ ซึ่งเป็นภารกิจที่ยากกว่าความสามารถของเกะนินปกติจะทำได้ ทำให้คาคาชิมีความมั่นใจในความสามารถของทั้งสามคน จึงได้ส่งรายชื่อของพวกเขาเข้าร่วมการสอบเลื่อนระดับเป็น จูนิน (นินจาระดับกลาง) โดยการสอบรอบแรกเป็นการทดสอบการลอบสืบข้อมูล ซึ่งนารูโตะได้แสดงวิถีนินจาของตัวเองออกมา
ในระหว่างการสอบรอบที่สอง ซึ่งทำการสอบกันในป่ามรณะ โอโรจิมารุ แห่งหมู่บ้าน โอโตะ ก็ได้ลอบเข้ามาทำร้ายซาสึเกะ แต่ก็ถูกนารูโตะ ซากุระ และเกะนินอื่นที่เข้าร่วมการสอบขัดขวางไว้ได้ อย่างไรก็ตาม โอโรจิมารุได้ผนึกอักขระต้องสาปไว้กับซาสึเกะ ซึ่งช่วยให้เขามีพลังในการต่อสู้เพิ่มขึ้น เมื่อถูกอักขระเข้าครอบงำ หลังจากต้องผจญกับอุปสรรคต่างๆ ทีมของนารูโตะก็สามารถผ่านการสอบรอบที่สองมาได้ แต่การสอบรอบที่สาม เป็นการประลองฝีมือตัวต่อตัวแบบแพ้คัดออก ระหว่างเกะนินที่เข้าสอบด้วยกัน ในการต่อสู้รอบแรกนารูโตะสามารถเอาชนะคิบะมาได้ ส่วนการประลองในรอบที่สองซึ่งจะเริ่มในอีก 1 เดือน นารูโตะจะต้องต่อสู้กับเนจิ
นารูโตะ นินจาจอมคาถา ตอนที่ 1 มาแล้ว! อุซึมากิ นารูโตะ
นารูโตะ นินจาจอมคาถา ตอนที่ 2 โคโนฮามารุ
นารูโตะ นินจาจอมคาถา ตอนที่ 3 ซาสึเกะกับซากุระปิ๊งกันหรือ?
นารูโตะ นินจาจอมคาถา ตอนที่ 4 ฝึกโหดเพื่อการอยู่รอด
นารูโตะ นินจาจอมคาถา ตอนที่ 5 เลิกเป็นนินจาซะ บทสรุปของคาคาชิ